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中國菲律賓中醫藥中心（Philippines TCM Center），是由福建中醫藥大學申請並獲得中國國家中醫藥管理局批准設立的「二０一八年度中醫藥國際合作專項立項項目」，也是福建省首個中醫藥海外中心建設項目，由福建中醫藥大學校長李燦東博士親自擔任項目負責人，本地名中醫暨福建中醫藥大學榮譽教授鄭啟明醫師擔任中心主任。
國家中醫藥管理局的國際合作專項項目：設有中醫藥海外中心建設類項目、中醫藥國際合作基地建設類項目和中醫藥國際文化傳播類項目三個類別，是國家中醫藥管理局貫徹執行《中醫藥「一帶一路」發展規劃（二０一六｜二０二０）》的具體任務，促進中醫藥國際文化傳播，推動中醫藥事業發展，而推動設立的重點示範性對外合作項目。
習近平主席二０一八年十一月來菲國事訪問期間，中華人民共和國與菲律賓共和國聯合聲明的第九條提到，雙方認為有必要加強醫療衛生合作。雙方領導人同意繼續拓展在傳統醫學、醫療專家和科技人員培訓、公共衛生、醫療信息化、衛生管理等領域的交流合作。傳統醫學的交流合作，已經隨著中菲關系的改善和加強，將進一步得到落實。
以福建中醫藥大學校長李燦東教授為團長訪菲代表團，此次訪菲，與菲華各界聯合會和中國菲律賓中醫藥中心，菲律賓科學健康促進會聯合在僑社舉辦義診活動，惠及數百名僑社民眾，受到菲律賓華僑的熱烈的歡迎和肯定。義診活動後，福建中醫藥大學訪菲代表團參加了中國菲律賓中醫藥中心的揭牌儀式。
中華人民共和國駐菲律賓大使館田善亭文化參贊，菲律賓總統中國事務特使William Lima，菲華商聯總會副理事長施偉廉先生，菲華各界聯合會名譽主席黃錫（方方土）先生，菲律賓衛生部傳統及替代醫學研究中心總幹事Dr. Anabelle De Guzman及曼達俞央市市長代表等主持了剪彩揭牌儀式，同時，福建中醫藥大學李燦東校長授予中國菲律賓中醫藥中心中醫健康管理海外協作單位的授牌儀式。菲華各界及菲律賓主流社會朋友，以及中央電視臺，新華社，中新社，菲中電視臺等媒體近二百人參與了揭牌活動。中國菲律賓中醫藥中心主任鄭啟明，主任醫師，世界中醫藥學會聯合會主席團執委，世界針灸學會聯合會執行委員。菲律賓注冊中醫及針灸師學會主席，菲律賓科學健康促進會主席。世中聯風濕專業委員會副會長，世界中醫藥服務貿易聯合會副主席。
中國菲律賓中醫藥中心將做為中醫藥文化傳播的平臺，促進菲律賓主流社會對中醫藥及針灸的認識。中國菲律賓中醫藥中心，以智能中醫，健康管理為主軸，推廣傳播中醫文化為己任，促進中醫藥在菲發展為目標，將智能化的中醫診療系統和電腦化的中醫智能配藥系統相結合，引進目前海外唯一的一臺中醫健康管理太空艙，為民眾的健康管理，預防疾病提供全面的養生和健康維護的目標。中醫健康管理太空艙時福建中醫藥大學健康管理團隊研發的將中醫的傳統診斷方法數據化，標准化，科學化的系統。該系統在國家中醫藥管理局的中國中醫藥行的香港及澳門的展覽，引起關注和轟動。福建中醫藥大學附屬第三人民醫院健康管理中心主任陳淑嬌博士親臨指導。前世界衛生組織總幹事陳馮富珍，匈牙利前總理等對此予以高度肯定。中心將以此系統為依托，真正的遠程中醫醫療將成為可能。中心將結合本地專業醫師和針灸師提供中醫藥及針灸服務，為常見病多方病的防治，體現中醫藥及針灸整體治療，天人合一，針藥並舉的優勢。中心還擁有同時，中心將以本中心的專家為主，結合有經驗的本地針灸中醫專家，開展不同的醫學講座，義診服務，讓更多的民眾能體會中醫藥及針灸的療效和優勢。中國菲律賓中醫藥中心位于 High Pointe Medical Hub, 241 Shaw Blvd. Mandaluyong City。
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